Se ti ha installo i software "puliti", giustamente come dici c'è un hardware che sballa la velocità.
Tra l'altro è abbastanza tipico che faccia credere al sistema di viaggiare a metà velocità di quella effettiva, in pratica è un chip che viene installato tra il sensore (che non è il magnete, ma quello che capta il magnetismo) e il motore, che dimezza (elettronicamente) i giri ruota. In questo modo il motore ti assiste fino alla velocità doppia a cui è impostato.
Solitamente questi chip sono inseriti in una scatolina celata sotto i carter plastici esterni del motore: prova a smontare il carter di sinistra e controllare se la trovi, seguendo i fili che partono dai cablaggi originali. Per togliere il carter devi disinstallare la pedivella sinistra, con il classico estrattore.
Vedi l'allegato 26384